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Jenne 自然部落 編譯: 面對事實，這就是“未來奇跡”的原因。

今天，分享一下人類學傢艾倫·羅傑斯的重要研究《尼安德特人和丹尼索瓦人的祖先與遠親的古人類雜交》，歐亞大陸被稱為“超古代”的群體可能也是意大利古火山“魔鬼的腳印”的創造者。感興趣的專業童鞋可去《科學進展》官網閱讀英文原版論文或在本公號後臺找小編索取PDF，本文隻作為科普，參考。

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本文2188字。閱讀大約需要6分鐘

圖片來源：C0公共領域

發現古代人類之間最早的雜交事件

猶他大學 2020 年 2 月 20

三年來，人類學傢艾倫·羅傑斯一直試圖解決一個進化難題。他的研究通過分析被稱為古人類的古代人類物種的 DNA 鏈來解開數百萬年的人類進化過程。像許多進化遺傳學傢一樣，羅傑斯比較瞭人類基因組，尋找遺傳模式，如突變和共享基因。他開發瞭推斷古代人口歷史的統計方法。

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2017 年，羅傑斯領導的一項研究發現，尼安德特人和丹尼索瓦人這兩個古代人類譜系的分離時間比以前想象的要早得多，並提出瞭人口規模的瓶頸。這引起瞭一些爭議——人類學傢 馬費索尼和普呂弗認為他們分析 DNA 的方法產生瞭不同的結果。羅傑斯同意瞭，但意識到這兩種方法都不能很好地解釋遺傳數據。

“我們正在討論的兩種方法都遺漏瞭一些東西，但是什麼？” 猶他大學人類學教授羅傑斯問道。

圖 1包含四個基因流片段的種群網絡，具有嵌入的基因譜系。

大寫字母（X、Y、N、D和S）代表人口（非洲、歐洲、尼安德特人、丹尼索瓦人和超古代）。希臘字母標記混合物的情節。d和xyn說明瞭兩種核苷酸位點模式，其中 0 和 1 代表祖先和衍生等位基因。紅色分支上的突變會產生位點模式d。藍色分支上的一個將生成xyn。為簡單起見，這個數字用一個字母指代尼安德特人。在其他地方，我們使用兩個字母來區分阿爾泰人和 Vindija 尼安德特人。

這項新研究解決瞭這個難題，並在此過程中記錄瞭已知最早的古代人類種群之間的雜交事件——大約 70 萬年前，歐亞大陸被稱為“超古代”的群體與尼安德特人 – 丹尼索瓦人的祖先雜交。該事件發生在兩個種群之間，這兩個種群之間的關系比任何其他記錄中的親緣關系都要遠。作者還提出瞭人類從非洲遷移到歐亞大陸的修訂時間表。分析古代 DNA 的方法提供瞭一種比以往任何時候都更深入地回顧人類譜系的新方法。（參考雜（濫）交   四處溜達  逮啥吃啥—-古人也瘋狂（收藏圖））

該研究的主要作者羅傑斯說：“我們從來不知道這種雜交事件，我們也從來無法估計超古代種群的規模。” “我們隻是揭示瞭人類進化史的一段之前完全黑暗的時期。”

該論文於 2020 年 2 月 20 日發表在《科學進展》雜志上。

走出非洲與雜交

羅傑斯研究瞭現代非洲人和歐洲人以及古代尼安德特人和丹尼索瓦人之間共享突變的方式。共享模式暗示瞭五次雜交，其中包括以前未知的一次。新發現的事件涉及 70萬 多年前在大約 200 萬年前與所有其他人類分離的遠親“超古代”種群與尼安德特人和丹尼索瓦人的祖先之間的雜交。（參考來自丹尼索瓦洞穴的更新世沉積物 DNA）

圖 2模型平均參數估計，具有 95% 置信區間，通過移動塊引導 ( 35 )估計。

關鍵：m α，從N滲入的Y 的分數；m β，從S滲入的D 的分數；m γ，從XY滲入的N 的分數；m δ，從S滲入的ND 的分數；T XYNDS，超古分離時間；T XY，X和Y 的分離時間；T ND , N和D 的分離時間; T N 0，尼安德特人歷史的早期時代結束；T A，阿爾泰尼安德特人化石年齡；T V，Vindija 尼安德特人化石的年齡；T D，丹尼索瓦人化石年齡；N S，超古代人口的規模；N XYND，種群規模XYND和XYNDS；N XY，人口規模XY；N ND，人口規模ND；N N 0，早期尼安德特人人口的規模；ñ ñ1，晚期尼安德特人人口規模。僅存在於一個模型中的參數不會被平均。

超古代和尼安德特人 – 丹尼索瓦人的祖先種群比以前已知的任何其他雜交人類種群的親緣關系更遠。例如，現代人和尼安德特人在雜交時已經分開瞭大約 75 萬年。超古代人和尼安德特人 – 丹尼索瓦人的祖先分開瞭超過一百萬年。

羅傑斯說：“這些關於人類世系雜交發生時間的發現，說明瞭生殖隔離進化需要多長時間。（ 參考 ”濫交有風險：尼安德特人的滅絕故事）

作者使用基因組中的其他線索來估計古代人類種群何時分離以及它們的有效種群規模。他們估計大約 200 萬年前，這個超古文明已經分裂成自己的物種。這與歐亞大陸 185 萬年前的人類化石證據一致。

研究人員還提出，人類遷入歐亞大陸的浪潮分為三波。第一次是在兩百萬年前，當超古代人遷移到歐亞大陸並擴展為大量人口時。然後在 70 萬年前，尼安德特人 – 丹尼索瓦人的祖先遷移到歐亞大陸，並迅速與超古代人的後代雜交。最後，現代人類在 5 萬年前擴展到歐亞大陸，我們知道他們在那裡與其他古代人類（包括尼安德特人）雜交。（參考尼安德特人將人乳頭瘤病毒傳給歐亞大陸的智人）

“在過去的幾年裡，我一直在研究這種分析基因數據以瞭解歷史的不同方式，”羅傑斯說。“令人欣慰的是，你想出瞭一種不同的方式來查看數據，最終發現瞭人們用其他方法無法看到的東西。”

探索

古老DNA的新面貌改寫人類進化故事

更多信息：AR羅傑斯等人，“尼安德特人 – 丹尼索瓦人祖先與遠親人類雜交”，科學進展（2020 年）。期刊信息：科學進展

提供 猶他大學